در فیلم جعبه پرنده بارسلونا یک نیروی مرموز و مشکوک همه کسانی که آن را می‌بینند از بین می‌برد. سباستین و دختر جوانش آنا برای زنده ماندن سفری را در خیابان‌های متروک بارسلون آغاز می‌کنند و به سمت یک پناهگاه امن می روند، اما...