سه سال پس از پایان ماجراجویی حماسی اول خود، موانا ندایی غیرمنتظره و قدرتمند از نیاکان دریانوردش دریافت می‌کند که او را به سفری تازه فرامی‌خواند. او درمی‌یابد که نالو، خدای انتقام‌جوی طوفان، جزیره‌ی افسانه‌ای و گمشده‌ی موتوفِتو را، که زمانی مانند پلی تمام جزایر اقیانوسیه را به هم متصل می‌کرد، به اعماق دریا فرو برده تا بر انسان‌ها تسلط یابد و آن‌ها را از هم جدا کند. موانا برای نجات مردمش و بازگرداندن تعادل به اقیانوس، باید راهی برای بالا آوردن دوباره این جزیره حیاتی پیدا کند. او گروهی متنوع متشکل از صنعتگر ماهر لوتو، مورخ دانا مونی و کشاورز عمل‌گرا کِله را گرد هم می‌آورد و همراه با حیوانات خانگی وفادارش، خوک پوآ و خروس هیهی، راهی سفری پرمخاطره به دریاهای دوردست و ناشناخته اقیانوسیه می‌شود.