داستان سریال ملکه سوندوک درباره یک ملکه زیباست که برای نجات مردم باید عشقش را رها کند. ملکه سئوندئوک، یک شاهزاده خانم به دنیا آمد و او مانند مردم عادی بزرگ شده بود و برای اینکه فرمانروای شهر سیلا شود آزمایشات و تست های سخت زیادی را پشت سر گذاشته.